Interdisciplinar é o termo que mais profundamente caracteriza a pedagogia do IEIJ, fundamentada na teoria epistemológica de Jean Piaget, que, devido à sua formação científica tão ampla, tinha condições de propor a si mesmo uma questão extremamente multidisciplinar que é a relação entre a adaptação dos seres vivos ao meio (sociobiologia) e a aprendizagem do ser humano.

A interdisciplinaridade significa uma integração e relação profunda, portanto afetivo-corporal-cognitiva entre os diversos grupos de elementos constitutivos da pedagogia – coordenadores, professores da Educação Infantil, do Fundamental, do corpo administrativo, dos funcionários de serviços gerais e pais para que o conhecimento e as fontes de conhecimento de cada elemento possam circular livremente, e atingir todos os outros elementos desta equipe.
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